ラウンド16 | 準々決勝 | 準決勝 | 決勝戦

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
37	09/09/21	11:00	ひたちなか	東京ヴェルディユース (Group D １位) 0 - 1 浦和レッズユース (Group Ｆ ３位)
38	09/09/21	11:00	群馬	横浜 Ｆ･マリノスユース (Group E １位) 1 - 0 桐光学園高校 (Group C ２位)
39	09/09/23	13:20	夢の島	ジェフユナイテッド千葉U-18 (Group B ２位) 1 - 2 米子北高校 (Group F ２位)
40	09/09/23	11:00	夢の島	三菱養和ＳＣユース (Group A １位) 2 - 1 前橋育英高校 (Group E ３位)
41	09/09/21	11:00	石巻フ	藤枝明誠高校 (Group B １位) 2 - 1 (Ex) 大阪桐蔭高校 (Group A ３位)
42	09/09/21	13:20	群馬	ヴィッセル神戸ユース (Group E ２位) 0 - 2 サンフレッチェ広島F.Cユース (Group A ２位)
43	09/09/21	13:20	石巻フ	ＦＣ東京U-18 (Group F １位) 3 - 1 広島観音高校 (Group D ２位)
44	09/09/21	13:20	ひたちなか	ジュビロ磐田ユース (Group C １位) 3 - 0 青森山田高校 (Group B ３位)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
45	09/10/03	13:20	ひたちなか	浦和レッズユース (Group Ｆ ３位) 0 - 2 横浜 Ｆ･マリノスユース (Group E １位)
46	09/10/03	11:00	ひたちなか	米子北高校 (Group F ２位) 0 - 2 三菱養和ＳＣユース (Group A １位)
47	09/10/04	13:20	Jヴィレッジ	藤枝明誠高校 (Group B １位) 0 - 2 サンフレッチェ広島F.Cユース (Group A ２位)
48	09/10/04	11:00	Jヴィレッジ	ＦＣ東京U-18 (Group F １位) 0 - 3 ジュビロ磐田ユース (Group C １位)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
49	09/10/10	12:00	国立	横浜 Ｆ･マリノスユース (Group E １位) 1 - 1 PK 5 - 4 三菱養和ＳＣユース (Group A １位)
50	09/10/10	14:30	国立	サンフレッチェ広島F.Cユース (Group A ２位) 2 - 2 PK 4 - 5 ジュビロ磐田ユース (Group C １位)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
51	09/10/12	13:00	埼玉S	横浜 Ｆ･マリノスユース (Group E １位) 7 - 1 ジュビロ磐田ユース (Group C １位)