１回戦 | ２回戦 | ３回戦 | ４回戦 | 準々決勝 | 準決勝 | 決勝戦

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
1	09/09/20	13:00	群馬サ	アルテ高崎 (群馬-8) 3 - 0 FC甲運 (山梨-初)
2	09/09/20	13:00	大和	東海大学 (神奈川-10) 1 - 0 順天堂大学 (千葉-13)
3	09/09/19	15:00	長良川球	FC岐阜SECOND (岐阜-2) 1 - 3 JAPANサッカーカレッジ (新潟-9)
4	09/09/20	13:00	紀三井寺	アルテリーヴォ和歌山 (和歌山-初) 2 - 3 佐賀東高校 (佐賀-初)
5	09/09/20	13:00	ひたちなか	流通経済大学 (茨城-6) 5 - 0 FCパラフレンチ米沢 (山形-初)
6	09/09/19	13:00	札幌厚別	ノルブリッツ北海道 (北海道-4) 0 - 4 福岡大学 (大学-25)
7	09/09/20	13:00	福山	福山大学 (広島-4) 0 - 1 Ｖ・ファーレン長崎 (長崎-3)
8	09/09/20	13:00	Jヴィレッジ	福島ユナイテッドFC (福島-2) 3 - 3 PK 3 - 1 尚美学園大学 (埼玉-3)
9	09/09/19	13:00	岡山	三菱水島FC (岡山-10) 1 - 1 PK 6 - 7 レノファ山口 (山口-8)
10	09/09/19	13:00	香川サ	カマタマーレ讃岐 (香川-11) 1 - 0 SC鳥取ドリームス (鳥取-初)
11	09/09/19	13:00	秋田陸	TDK SC (秋田-16) 1 - 2 ソニー仙台FC (宮城-12)
12	09/09/20	13:00	金沢	ツエーゲン金沢 (石川-6) 1 - 0 (Ex) 関西学院大学 (兵庫-20)
13	09/09/19	13:00	松本球	松本山雅FC (長野-4) 1 - 0 FC刈谷 (愛知-13)
14	09/09/19	13:00	鈴鹿	三重中京大学 (三重-4) 0 - 7 Honda FC (静岡-34)
15	09/09/20	15:00	沖縄北谷	沖縄かりゆしFC (沖縄-6) 4 - 1 徳島ヴォルティス・セカンド (徳島-4)
16	09/09/20	13:00	宮崎市	ホンダロック (宮崎-8) 4 - 0 熊本学園大学 (熊本-初)
17	09/09/21	13:00	ニンスタ	愛媛ＦＣしまなみ (愛媛-初) 0 - 4 高知大学 (高知-14)
18	09/09/21	13:00	鴨池	鹿屋体育大学 (鹿児島-8) 2 - 0 浜田FCコスモス (島根-初)
19	09/09/20	13:00	大分サA	日本文理大学 (大分-5) 1 - 0 ニューウェーブ北九州 (福岡-2)
20	09/09/20	13:00	盛岡南	グルージャ盛岡 (岩手-3) 2 - 4 明治大学 (東京-12)
21	09/09/20	13:00	奈良橿原	奈良クラブ (奈良-初) 1 - 0 サウルコス福井 (福井-2)
22	09/09/21	13:00	皇子山	びわこ成蹊スポーツ大学 (滋賀-3) 0 - 1 佐川印刷SC (京都-6)
23	09/09/20	13:00	栃木市	ヴェルフェたかはら那須 (栃木-初) 4 - 3 (Ex) 八戸大学 (青森-8)
24	09/09/20	13:00	富山	ヴァリエンテ富山 (富山-初) 0 - 7 関西大学 (大阪-13)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
25	09/10/11	13:00	カシマ	鹿島アントラーズ (J1-26) 1 - 0 アルテ高崎 (群馬-8)
26	09/10/11	13:00	ニンスタ	愛媛ＦＣ (J2-11) 2 - 2 PK 2 - 4 アビスパ福岡 (J2-18)
27	09/10/11	13:00	ホムスタ	ヴィッセル神戸 (J1-23) 5 - 0 東海大学 (神奈川-10)
28	09/10/11	13:00	柏の葉	柏レイソル (J1-42) 0 - 0 PK 4 - 2 ジェフリザーブズ (JFL-4)
29	09/10/11	13:00	コカ広島ス	サンフレッチェ広島 (J1-58) 5 - 0 JAPANサッカーカレッジ (新潟-9)
30	09/10/10	13:00	佐賀陸	サガン鳥栖 (J2-18) 5 - 0 佐賀東高校 (佐賀-初)
31	09/10/11	13:00	万博	ガンバ大阪 (J1-29) 5 - 2 流通経済大学 (茨城-6)
32	09/10/10	15:00	ひたちなか	水戸ホーリーホック (J2-14) 2 - 3 (Ex) 福岡大学 (大学-25)
33	09/10/11	13:00	長崎県	Ｖ・ファーレン長崎 (長崎-3) 0 - 4 横浜Ｆ・マリノス (J1-32)
34	09/10/11	13:00	長居	セレッソ大阪 (J2-41) 1 - 2 福島ユナイテッドFC (福島-2)
35	09/10/11	13:00	等々力	川崎フロンターレ (J1-26) 6 - 1 レノファ山口 (山口-8)
36	09/10/11	13:00	富山	カターレ富山 (J2-2) 0 - 0 PK 4 - 1 ファジアーノ岡山 (J2-2)
37	09/10/11	15:00	味スタ	ＦＣ東京 (J1-16) 4 - 0 カマタマーレ讃岐 (香川-11)
38	09/10/10	13:00	群馬サ	ザスパ草津 (J2-7) 3 - 1 ＳＡＧＡＷＡ ＳＨＩＧＡ ＦＣ (JFL-3)
39	09/10/11	13:00	秋田陸	ソニー仙台FC (宮城-12) 2 - 4 大宮アルディージャ (J1-15)
40	09/10/10	13:00	ユアスタ	ベガルタ仙台 (J2-16) 1 - 0 (Ex) ツエーゲン金沢 (石川-6)
41	09/10/11	13:00	松本球	松本山雅FC (長野-4) 2 - 0 浦和レッズ (J1-45)
42	09/10/11	13:00	長良川	ＦＣ岐阜 (J2-4) 1 - 0 栃木ＳＣ (J2-12)
43	09/10/11	13:00	大分陸	大分トリニータ (J1-14) 3 - 3 PK 4 - 3 横河武蔵野FC (JFL-2)
44	09/10/12	13:00	フクアリ	ジェフユナイテッド千葉 (J1-45) 3 - 0 Honda FC (静岡-34)
45	09/10/10	13:00	刈谷	名古屋グランパス (J1-33) 4 - 0 沖縄かりゆしFC (沖縄-6)
46	09/10/11	13:00	西が丘	東京ヴェルディ (J2-35) 0 - 1 ホンダロック (宮崎-8)
47	09/10/11	13:00	ヤマハ	ジュビロ磐田 (J1-33) 2 - 0 高知大学 (高知-14)
48	09/10/11	13:00	徳島球	徳島ヴォルティス (J2-21) 1 - 3 鹿屋体育大学 (鹿児島-8)
49	09/10/11	13:00	NDスタ	モンテディオ山形 (J1-18) 2 - 0 日本文理大学 (大分-5)
50	09/10/10	15:00	平塚	湘南ベルマーレ (J2-38) 0 - 1 明治大学 (東京-12)
51	09/10/11	13:00	福井テクノ	奈良クラブ (奈良-初) 0 - 3 アルビレックス新潟 (J1-18)
52	09/10/11	19:00	熊本	ロアッソ熊本 (J2-10) 2 - 2 PK 2 - 4 横浜ＦＣ (J2-11)
53	09/10/11	13:00	アウスタ	清水エスパルス (J1-18) 2 - 0 佐川印刷SC (京都-6)
54	09/10/11	13:00	札幌厚別	コンサドーレ札幌 (J2-29) 2 - 1 ガイナーレ鳥取 (JFL-12)
55	09/10/10	13:00	西京極	京都サンガF.C. (J1-27) 4 - 0 ヴェルフェたかはら那須 (栃木-初)
56	09/10/11	13:00	小瀬	ヴァンフォーレ甲府 (J2-18) 3 - 3 PK 4 - 3 関西大学 (大阪-13)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
57	09/10/31	13:00	カシマ	鹿島アントラーズ (J1-26) 3 - 0 アビスパ福岡 (J2-18)
58	09/10/31	13:00	ホムスタ	ヴィッセル神戸 (J1-23) 1 - 0 柏レイソル (J1-42)
59	09/10/31	15:00	コカ広島ス	サンフレッチェ広島 (J1-58) 2 - 3 サガン鳥栖 (J2-18)
60	09/10/31	13:00	万博	ガンバ大阪 (J1-29) 6 - 1 福岡大学 (大学-25)
61	09/11/01	15:00	日産ス	横浜Ｆ・マリノス (J1-32) 4 - 1 福島ユナイテッドFC (福島-2)
62	09/11/11	19:00	等々力	川崎フロンターレ (J1-26) 3 - 1 カターレ富山 (J2-2)
63	09/11/11	19:00	長崎県	ＦＣ東京 (J1-16) 3 - 2 ザスパ草津 (J2-7)
64	09/10/31	15:00	NACK	大宮アルディージャ (J1-15) 1 - 2 (Ex) ベガルタ仙台 (J2-16)
65	09/10/31	13:00	秋田陸	松本山雅FC (長野-4) 1 - 4 ＦＣ岐阜 (J2-4)
66	09/11/01	13:00	九石ド	大分トリニータ (J1-14) 2 - 3 ジェフユナイテッド千葉 (J1-45)
67	09/11/01	15:00	瑞穂陸	名古屋グランパス (J1-33) 2 - 0 ホンダロック (宮崎-8)
68	09/10/31	13:00	ヤマハ	ジュビロ磐田 (J1-33) 3 - 1 (Ex) 鹿屋体育大学 (鹿児島-8)
69	09/10/31	13:00	NDスタ	モンテディオ山形 (J1-18) 0 - 3 明治大学 (東京-12)
70	09/10/31	15:00	東北電ス	アルビレックス新潟 (J1-18) 3 - 1 横浜ＦＣ (J2-11)
71	09/10/31	13:00	アウスタ	清水エスパルス (J1-18) 2 - 0 コンサドーレ札幌 (J2-29)
72	09/10/31	13:00	西京極	京都サンガF.C. (J1-27) 1 - 2 (Ex) ヴァンフォーレ甲府 (J2-18)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
73	09/11/14	15:00	カシマ	鹿島アントラーズ (J1-26) 2 - 1 ヴィッセル神戸 (J1-23)
74	09/11/14	13:00	広島ビ	サガン鳥栖 (J2-18) 1 - 3 ガンバ大阪 (J1-29)
75	09/11/15	15:00	日産ス	横浜Ｆ・マリノス (J1-32) 1 - 2 川崎フロンターレ (J1-26)
76	09/11/15	13:00	丸亀	ＦＣ東京 (J1-16) 0 - 3 ベガルタ仙台 (J2-16)
77	09/11/15	13:00	熊谷陸	ＦＣ岐阜 (J2-4) 1 - 0 ジェフユナイテッド千葉 (J1-45)
78	09/11/15	15:00	瑞穂陸	名古屋グランパス (J1-33) 3 - 1 ジュビロ磐田 (J1-33)
79	09/11/15	13:00	NDスタ	明治大学 (東京-12) 1 - 3 アルビレックス新潟 (J1-18)
80	09/11/14	13:00	とりスタ	清水エスパルス (J1-18) 3 - 0 ヴァンフォーレ甲府 (J2-18)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
81	09/12/12	15:00	カシマ	鹿島アントラーズ (J1-26) 1 - 2 ガンバ大阪 (J1-29)
82	09/12/12	13:00	ユアスタ	ベガルタ仙台 (J2-16) 2 - 1 (Ex) 川崎フロンターレ (J1-26)
83	09/12/13	15:00	瑞穂陸	名古屋グランパス (J1-33) 3 - 0 ＦＣ岐阜 (J2-4)
84	09/12/12	13:00	アウスタ	清水エスパルス (J1-18) 3 - 2 (Ex) アルビレックス新潟 (J1-18)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
85	09/12/29	15:00	国立	ガンバ大阪 (J1-29) 2 - 1 ベガルタ仙台 (J2-16)
86	09/12/29	13:00	エコパ	名古屋グランパス (J1-33) 1 - 1 PK 5 - 3 清水エスパルス (J1-18)

No.	日程	時間	会場	対戦カード	公式記録
87	10/01/01	14:00	国立	ガンバ大阪 (J1-29) 4 - 1 名古屋グランパス (J1-33)